خودکفایی در تولید پنیر و بی‌نیاز شدن بازار ایران از پنیرهای وارداتی یکی از شیرین‌ترین خاطرات و باشکوه‌ترین دستاوردهای پگاه است. شرکت صنایع شیر ایران از دهه ۷۰ شمسی خط تولید پنیر ایرانی را راه‌اندازی کرد و در سال ۱۳۷۵ با تولید پنیرهای فرافیلتر شده توانست سفره‌های ایرانیان را با پنیر پاستوریزه خود زینت بخشد.
در حال حاضر پگاه به‌عنوان بزرگترین تولیدکننده پنیر در کشور، محصولات خود را در طعم‌ها و بسته‌بندی‌های متنوع با استفاده از به‌روزترین تجهیزات در بازار داخل و ۲۷ کشور دنیا عرضه می‌کند.
تنوع‌پذیری پنیرهای پگاه هیچگاه در زمان متوقف نشده و تولید «پنیر کوزه‌» در سال پایانی قرن چهاردهم خورشیدی نشان از احترام به ذائقه مشتری و حفظ طعم کهن این محصول است.